Das Master of Science-Programm für Projektmanagement ist ein 36-Stunden-Programm, das traditionelle und agile Projektmanagementprogramme anbietet, die auf lokale und globale Bedürfnisse eingehen. Dieses Programm ist vom Global Accreditation Center for Project Management Education Programs (GAC) akkreditiert. GAC ist eine unabhängige akademische Akkreditierungsstelle mit Richtlinien, Verfahren und Standards für Projekt-, Programm-, Portfoliomanagement und verwandte Programme auf Bachelor-, Postgraduierten- und Doktoratsebene. Der MS-Studiengang Projektmanagement der HU ist einer von nur 110 Studiengängen weltweit, die diese Akkreditierung erhalten.

Das Cybersecurity Operations and Control Management-Programm der Harrisburg University wurde entwickelt, um die Nachfrage nach Cybersicherheitsexperten zum Schutz der IT-Assets von Unternehmen zu decken, die den täglichen Cybersicherheitsbetrieb in jeder Organisation abwickeln. Die Absolventen des Programms arbeiten in verschiedenen Branchen in Cybersicherheitsrollen wie Cybersicherheitsingenieur oder -architekt, Cloud-Sicherheitsanalyst, Cloud-Sicherheitsingenieur oder -architekt, Datenschutzbeauftragter, Informationssicherheitsbeauftragter oder -prüfer, Chief Information Security Officer oder Berater.